水污染不仅仅是由工厂所排放的大量工业废水造成的，人们日常生活中所排放的生活污水也会对水资源造成很大的影响。随着农村生活水平的提高，人们所排放的生活污水也在不断增多，这就造成了农村的水污染环境十分严重，我们要及时对水污染进行治理。
生活污水不经处理直接排入内河涌，成为成为农村水环境污染的罪魁祸首。随着农民生活水平的提高及生活方式的改变，生活污水的产生量随之增长，除了人粪便、厨房污水外，还有家庭清洁、生活垃圾堆放渗滤产生的污水。由于村庄布局分散的地理特征，造成污水分散、难于收集，绝大部分村庄基本上都未建有有污水处理设施，生活污水不经处理便直接排入内河涌。
人工湿地系统投资少、工艺简单、能耗低、维护管理方便，可以有效地去除氮磷污染物，因此人工湿地在农业面源污染控制方面具有良好的应用前景。可以考虑以自然村为单位建设分散式的人工湿地，将各自村内的生活污水通过简易的收集管道收集到人工湿地进行处理。经过人工湿地的净化后，可有效缓解其对水环境的污染。
随着禽畜养殖业的发展，禽畜粪便排放量急剧增加，也成为农村环境污染的主要来源之一。未经处理的畜禽粪便直接排放进入水体或任意堆放，严重污染地下水和地表水环境。我们必须加强对畜禽养殖污染防治监管。对新、改、扩建的规模化畜禽养殖场要严格执行环评制度，合理确定畜禽养殖规模;对比较大型的畜禽养殖场要按要求建设污染治理设施。与此同时，加强执法监管，全面清理禁养区内的畜禽养殖场，对没有达标的畜禽养殖场进行限期治污改造。
农村不少单位耕地面积的化肥和农药的投入量不少，而利用率却很低，大量的化肥和农药流失，导致农田土壤污染，通过农田径流加剧了内河涌等水体的富营养化，从而造成了水体面源污染。我们必须从源头上控制化肥和农药使用量，实行生态平衡施肥技术和生态防治技术，提高化肥和农药利用效率，从而达到减少化肥、农药可能造成的水环境污染，提高农村水环境质量的目的。